Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASCL3Q9NQ33 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ASCL3Q9NQ33 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms