Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ROPN1BQ9BZX4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms