Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL3Q9BY60 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL3Q9BY60 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms