Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BBS2Q9BXC9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms