Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT23

LIMD2, LIM domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD2Q9BT23 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LIMD2Q9BT23 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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