Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTKNQ9BST9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms