Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPS6KC1Q96S38 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms