Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
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USP47Q96K76 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP47Q96K76 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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