Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF496Q96IT1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF496Q96IT1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms