Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RTP4Q96DX8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms