Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSPRY1Q96DX4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms