Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC59Q96AG4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC59Q96AG4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms