Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTSSAQ969W0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms