Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAVIN3Q969G5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms