Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms