Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CSRNP3Q8WYN3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms