Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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NUP35Q8NFH5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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NUP35Q8NFH5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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NUP35Q8NFH5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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NUP35Q8NFH5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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