Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NUP35Q8NFH5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NUP35Q8NFH5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms