Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BHLHE23Q8NDY6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHE23Q8NDY6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms