Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRRC17Q8N6Y2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRRC17Q8N6Y2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms