Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms