Protein–RNA interactions for Protein: Q86X40

LRRC28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28Q86X40 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC28Q86X40 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC28Q86X40 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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