Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT28Q7Z3Y7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms