Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
CSAG1Q6PB30 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms