Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms