Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LCN10Q6JVE6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LCN10Q6JVE6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms