Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0B8

TIGD3, Tigger transposable element-derived protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD3Q6B0B8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TIGD3Q6B0B8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms