Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM208BQ5VWN6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM208BQ5VWN6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms