Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP27-1Q3LI81 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms