Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q1T7F1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q1T7F1 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Q1T7F1 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
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