Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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