Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDKN3Q16667 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDKN3Q16667 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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