Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CTF1Q16619 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTF1Q16619 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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