Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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ECM1Q16610 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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ECM1Q16610 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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ECM1Q16610 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ECM1Q16610 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ECM1Q16610 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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