Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FXNQ16595 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FXNQ16595 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FXNQ16595 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FXNQ16595 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FXNQ16595 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FXNQ16595 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FXNQ16595 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FXNQ16595 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FXNQ16595 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FXNQ16595 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FXNQ16595 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FXNQ16595 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FXNQ16595 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FXNQ16595 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FXNQ16595 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FXNQ16595 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FXNQ16595 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FXNQ16595 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FXNQ16595 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FXNQ16595 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FXNQ16595 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FXNQ16595 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FXNQ16595 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FXNQ16595 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FXNQ16595 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FXNQ16595 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FXNQ16595 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FXNQ16595 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FXNQ16595 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FXNQ16595 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FXNQ16595 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FXNQ16595 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FXNQ16595 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FXNQ16595 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FXNQ16595 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FXNQ16595 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FXNQ16595 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FXNQ16595 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FXNQ16595 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FXNQ16595 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FXNQ16595 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FXNQ16595 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FXNQ16595 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
FXNQ16595 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FXNQ16595 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FXNQ16595 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FXNQ16595 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FXNQ16595 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FXNQ16595 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FXNQ16595 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FXNQ16595 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms