Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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VAMP3Q15836 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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