Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP10Q15642 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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