Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTF1Q15361 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTF1Q15361 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms