Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
EEA1Q15075 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
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EEA1Q15075 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
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EEA1Q15075 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
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EEA1Q15075 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EEA1Q15075 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
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