Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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BRD3Q15059 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
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BRD3Q15059 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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BRD3Q15059 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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BRD3Q15059 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRD3Q15059 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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