Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3GAP1Q15042 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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