Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NWD1Q149M9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NWD1Q149M9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
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