Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
COL4A6Q14031 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms