Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CBFBQ13951 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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