Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALCAMQ13740 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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