Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FHL3Q13643 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms