Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BFSP2Q13515 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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