Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 AL031430.1-201ENST00000642067 1039 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MKRN4PQ13434 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 ETFRF1-209ENST00000556885 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 AC009652.1-201ENST00000528326 648 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKRN4PQ13434 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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