Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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SKP2Q13309 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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