Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME3Q13232 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME3Q13232 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME3Q13232 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME3Q13232 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME3Q13232 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME3Q13232 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME3Q13232 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NME3Q13232 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME3Q13232 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME3Q13232 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME3Q13232 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME3Q13232 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME3Q13232 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME3Q13232 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME3Q13232 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME3Q13232 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME3Q13232 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NME3Q13232 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NME3Q13232 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME3Q13232 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME3Q13232 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME3Q13232 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME3Q13232 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME3Q13232 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME3Q13232 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME3Q13232 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME3Q13232 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME3Q13232 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NME3Q13232 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NME3Q13232 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NME3Q13232 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME3Q13232 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME3Q13232 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME3Q13232 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME3Q13232 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME3Q13232 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME3Q13232 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME3Q13232 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME3Q13232 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NME3Q13232 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NME3Q13232 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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