Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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